Analyse avancée de séquences

Objectifs, programme, validation de la formation

Objectifs

• Savoir rechercher des informations dans les banques de données
• Maîtriser les outils d’analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats
• Maîtriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS)
• Savoir utiliser l’environnement Galaxy

Description, programmation

1[sup]er[/sup] jour

• Organisation des banques de données publiques
• Recherche d’information dans les banques de données publiques
• Premier pas avec Galaxy
• Comparaison et alignement multiple de séquences
• Notions de familles de protéines et domaines fonctionnels

2[sup]ème[/sup] jour

• Etat de l’art du séquençage haut débit
• Formats et manipulation des données NGS

3[sup]ème[/sup] jour

• Analyse avancée à partir de données NGS
• Après-midi : les stagiaires sont invités à apporter leurs données qui seront utilisées à des fins pédagogiques pour les exercices.

Niveau de sortie information non communiquée

Métiers visés

M1801 :

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Durée, rythme, financement

Durée 20 heures en centre

Modalités de l'alternance -

Conventionnement Non

Conditions d'accès

Modalités de recrutement et d'admission Aucun

Niveau d'entrée sans niveau spécifique

Conditions spécifiques et prérequis Aucun

Inscription

Contact renseignement GIRAUD

Téléphone 0169824455

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Périodes prévisibles de déroulement des sessions

Session débutant le : 19/10/2021

Adresse d'inscription
1 Rue Camille St Saens 33077 Bordeaux

Lieu de formation

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Organisme de formation responsable