Préparer des banques NGS à partir d'ADN et d'ARN - les étapes pratiques et méthodologiques appliquées à la technologie Illumina

Objectifs, programme, validation de la formation

Objectifs

Comprendre les technologies de séquençage IlluminaSavoir identifier les points limitants avant le développement d’un projet de séquençage

conquérir les compétences pratiques et théoriques pour la réalisation de ses projets NGS

Maîtriser les étapes de construction et de validation d’une banque NGS pour être autonome

Maîtriser les équipements pour la quantification et qualification des acides nucléiques et la sélection de taille

Description, programmation

Module théorique (5 h)

• La technologie de séquençage Illumina
• Les principales méthodes de construction de banques NGS 
• Format des données générées et généralités sur l’analyse primaire des données
• Potentiel des applications de séquençage (illustrations, exemplifications)
  Module pratique (12 h)
• Un exemple de construction de banques à partir d’ADN : séquençage de petits génomes
• Un exemple de construction de banques à partir d’ARN : séquençage RNAseq
• Quantification et qualification des ADN et des ARN
• Construction d’une banque à partir d’ADN et d’ARN
• Contrôle qualité de banques avant séquençage
• Séquençage sur plateforme Illumina (NextSeq500)
• Récupération des données de séquençage et critères de validation.
  La dernière demi-journée (3 h) sera consacrée à l’analyse de cas exposés par les stagiaires (questions spécifiques, projets propres de séquençage)

Validation et sanction

Attestation de formation

Type de formation

Perfectionnement, élargissement des compétences

Niveau de sortie sans niveau spécifique

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Durée, rythme, financement

Durée 20 heures en centre

Modalités de l'alternance -

Conventionnement Non

Conditions d'accès

Niveau d'entrée sans niveau spécifique

Conditions spécifiques et prérequis Connaissances de base en biologie moléculaire

Inscription

Contact renseignement Samanta Institut de génomique fonctionnelle de Lyon

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Périodes prévisibles de déroulement des sessions

Session débutant le : 11/10/2021

Adresse d'inscription
CNRS Formation Entreprises
1 avenue de la Terrasse
Batiment 31 91190 Gif-sur-Yvette

Lieu de formation

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Organisme de formation responsable